1995年9月，朱芳雨被广西自治区体校教练苏国培挑中，并对他进行重点培养。1998年9月，朱芳雨进入广西男篮，同年底进入广东宏远青年队，12月被国家青年队选中。1999年时成为广东宏远正式球员，但当时未办妥转会手续未能注册。2001年被选入国家队征战世界大学生运动会。

朱芳雨的职业生尤为辉煌，随广东队8次夺得CBA总冠军。作为广东队的核心球员，朱芳雨两度当选CBA常规赛MVP（2007-08、2011-12）和三次FMVP（2007-08、2008-09、2009-10），荣誉上堪称CBA二十年来第一人。2014年11月26日同辽宁之战，朱芳雨砍下34分，个人总得分超过一万分，也成为CBA史上首位总得分超过一万分的球员。

11月23日讯 广东华南虎篮球俱乐部总经理朱芳雨今日收到一封球迷来信，这位球迷就球队目前存在的问题提出一些建议。对此，朱芳雨表示这位球迷的建议很中肯，并透露已经将信件分发给队员观看。

“这位球迷提的建议很中肯，也很实在，已经发给队员，每个球员这段时间已经在训练前后都会给自己加练。今天开始另外要求在这段时间全队训练结束后给自己额外加练投篮次数，三分命中率要达到80%以上，罚球90%以上。训练只有达到这样的命中率，比赛里才有可能达到要求。谢谢球迷提出的宝贵建议。”朱芳雨在微博上写道。