水稻褐变穗是由链格孢属的真菌引起的病害。水稻叶片上没有病斑，抽出穗来，稻粒变成红褐色或黑褐色。影响水稻的产量和品质。特别影响水稻种子的外观品相和大米内在的品质。必须在水稻出穗前后做好预防。

1、症状：该病主要发生在穗部，水稻抽穗后，水稻颖壳上出现褐色斑点，病斑扩展成不规则形，病斑上没有霉层，但病健分界处明显。发病重的稻粒空瘪，并有黑背米混杂，水稻叶鞘不变褐，一般减产5%左右，重者减产10%-15%，严重影响水稻品质。又称之为“锈粒”、“黑穗”。

2、侵染循环：病原菌在稻粒、稻秆、禾本科杂草的枯死株上越冬，成为下一年的侵染源。

3、病原鉴定：在显微镜下观察菌丝无色，多隔；分生孢子梗直接生于气生菌丝上，分生孢子梗单生，褐色，柱状或屈膝状，不分枝，少数一次分生孢子链生，卵形、倒梨形或近椭圆形，褐色，表面光滑，1-7个横隔，1-4个纵、斜隔膜，22.5-40微米×8-13.5微米。

4、田间管理：防止稻叶早枯，日常注意肥水管理，合理施用氮、磷、钾肥，提高地力。施用硅肥可提高水稻抗病性，减轻发病。

5、药剂防治：在消灭池埂及四周禾本科杂草，减少菌源基础上，水稻孕穗末期、齐穗期选用3%多抗霉素80毫升/亩,或5%多抗霉素50～60毫升/亩，兑水5升弥雾机茎叶喷雾，或航化喷药防治。

多病统防：防治褐变穗可以用多抗霉素和防治其它病害的杀菌剂复配，同时防治多种病害。例如用春雷霉素·三环唑加多抗霉素、氟环唑·稻瘟灵加多抗霉素等