尽管临床报道关于肌酸补充的唯一副作用就是体重增加[4,18,22]，许多关于肌酸副作用的谣传仍然经常在媒体和大众文章中见到，包括脱水、抽筋、肾脏和肝脏损伤、肌肉骨骼损伤、肠胃不适和前（腿部）筋膜室综合征等。尽管使用一水肌酸的运动员可能会出现这些症状，但科学研究表明，这些运动员与那些未补充一水肌酸的运动员出现这些症状的几率并没有区别。

许多这样的恐惧都来自媒体或者个案研究(n=1)。Poortmans和Francaux在1998年报道了肌酸补充剂对肾功能造成有害影响的研究结果[68]。这一结果显示一名本来患有肾脏疾病（肾小球硬化及皮质类固醇激素敏感的肾病综合征）的25岁男子补充肌酸后对其肾小球滤过率(GFR)造成了有害的影响[69]。三天后，一家法国体育报纸《L'Equipe》报道在任何情况下补充肌酸对于肾脏都是危险的[70]。几家欧洲报纸然后也转发了同样的新闻。从那时起，其他一些支持一水肌酸补充对肾脏功能具有副作用的个案报道也陆续发表。

很多对一水肌酸补充和肾功能关系的关注均集中在增加的血清肌酐水平上。虽然肌酐确实构成了肾小球滤过率的一部分，并必须经肾排泄，但尚无证据支持健康成人在正常肌酸摄入量(<25g/d)时会导致肾功能不全。事实上，Poortmans等人的研究显示，短期（5天）、中期（14天）或长期（5年10个月）的一水肌酸补充对肾脏都没有不利影响[5,73,74]。有趣的是，德尔等人[4]观察到一水肌酸补充组受试者和对照组的肌酐水平并没有显著差异，但大多数运动员（不论是否补充一水肌酸）在高强度训练期间肌酐水平及其清除能力都会升高。

作者指出，如果把血清肌酐检查作为反映肾功能的唯一指标，那么几乎所有的运动员（不管是否使用肌酸以及如何使用）都存在肾功能下降的问题。尽管案例研究指出了一些问题，但这些大样本对照研究表明，没有证据显示一水肌酸补充会造成健康个体的肾功能损害。

补充肌酸的另一个谣传就是认为其长期影响未知。一水肌酸的广泛使用始于20世纪90年代。近几年一些研究者已经开始报道长期使用安全性的试验结果。到目前为止，没有在运动员（使用长达5年），肌酸合成缺陷的婴儿（使用长达3年）或临床患者人群（使用长达5年）身上观察到肌酸的副作用[4,5,18,75,76]。在一项队列研究中，病人每天服用1.5-3克一水肌酸，自1981年开始进行监控，未发现明显的副作用[77,78]。

此外，研究表明一水肌酸对于心脏病患者、肌酸合成缺陷的婴儿和病人、骨科创伤患者以及各种神经肌肉疾病患者具有潜在的临床促进作用。自70年代中期以来就开始了补充肌酸的潜在医疗用途的相关研究。最初，研究集中在一水肌酸和（或）磷酸肌酸在降低缺血性事件中的心率失常和/或改善心功能方面的作用[18]。关于肌酸补充医疗用途的兴趣已拓展到包括肌酸缺乏[79-81]、脑和/或脊髓损伤[82-86]、肌营养不良症[87-90]、糖尿病[91]、高胆固醇/甘油三酯水平[92]和肺部疾病 [93]在内的其他疾病。虽然需要更多的研究以确定临床应用的程度，但大量研究已经表明肌酸补充剂对于特定的疾病人群可能有治疗效果。结合在健康人群中的短期和长期研究，可以证明符合推荐使用指南规定的肌酸补充似乎是安全的。